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理论学界莫衷一是的讨论也令高校教学工作困难重重，学科发展和学科地位也直线下降，教师感到政治经济学越来越难教了。
新的实践经验和理论成果没有及时反映到教材中来：教材内容陈旧，不能很好地解释和回答现实问题，自然就没有说服力。
两部制的教材内容体系之间没有很好地融合，前后不一致甚至自相矛盾，在专业知识传授上定性分析多而定量研究不足，显得没有西方经济学那么实用和精确；一些同学认为政治经济学只是空洞的理想、主义，西方经济学才更实用。
由于邓小平理论和政治经济学都讲社会主义经济理论，内容有所重复。
有不少高校为了避免重复，选择了不讲或者少讲社会主义部分。
这种回避现实的态度更加使思想教育的效果大打折扣。
政治经济学学科建设的滑坡现象还表现在师资队伍的萎缩、流失，不少教师改教西方经济学或者部门经济学；有些学校的经济类本科生不开设政治经济学，研究生考试也没有政治经济学的内容等等。
[7]一方面，政治经济学的地位下滑，具体表现在：一是教师教学热情在下降。
有一些政治经济学教师转行从事西方经济学或部门经济学的教学与研究工作，教师人数减少；二是学生学习热情在下降。
有些学校的经济学专业不开设政治经济学课程，部分学生不爱学习政治经济学；三是教材水平在下降。
政府部门很少请政治经济学专家讲课，政府官员不学政治经济学，在这种情况下，即使编写出好教材，可能也不会有多少人来学习，从而造成政治经济学教材的地位相对下滑的局面。
[8]另一方面，近年来，政治经济学学科建设面临严峻挑战。
这些挑战主要表现为：政治经济学课程的地位在高校经济和管理类专业中不断下降，有些学校的管理类专业的课程设置中甚至取消了政治经济学；许多高校的硕士和博士研究生入学考试取消了对政治经济学的考核；政治经济学对青年教师和青年学生的学术吸引力不断下降，西方经济学的分析思路和分析方法的影响力不断上升。
[9]应该说这一点是前两点的一个必然结果，既然理论对现实的解释力度不够，学科建设远远跟不上时代发展的步伐，同时自身的理论创新力度和能力又不够，自身理论发展举步维艰，那么作为一个学科，它的必然结果就是在同类学科中的地位的下降。
我国的政治经济学学科，不仅仅是学科地位下降这么简单，而是教师、学生和社会对学科缺乏信心，学科自身也很难在短期内加以根本的变革，加上类似于西方经济学理论和应用经济学等学科的冲击，马克思主义政治经济学在中国陷入困境也就在所难免了。
（三）科学社会主义学科建设状况
1.科学社会主义学科的历史沿革
马克思恩格斯的共产主义思想理论产生于19世纪40年代，在《共产党宣言》中，马克思恩格斯系统阐述了共产主义思想的特殊性与先进性，区别于资本主义和空想的社会主义，但是当时马克思还没有正式提出科学社会主义思想，甚至反对社会主义，而把自己创立的新理论称为共产主义。
在《共产党宣言》中，马克思和恩格斯分别批判了三种主要的社会主义思想，第一是反动的社会主义，包括封建的社会主义、小资产阶级的社会主义和德国的或“真正的”
社会主义；第二是保守的或资产阶级的社会主义；第三是批判的空想的社会主义。
马克思在批判了三种社会主义形式之后总结指出：“共产党人不屑于隐瞒自己的观点和意图。
他们公开宣布：他们的目的只有用暴力推翻全部现存的社会制度才能达到。
让统治阶级在共产主义革命面前发抖吧。
无产者在这个革命中失去的只是锁链。
他们获得的将是整个世界。”
[10]可见，马克思和恩格斯当时只是用共产主义革命来与从前的共产主义形态作出区别，事实上还没有正式提出科学社会主义的概念。
但是到了19世纪60—70年代，随着无产阶级革命的开展，共产主义理论受到了空想的社会主义等理论的重大影响，马克思因此旗帜鲜明地提出自己创立的是科学的社会主义，以区别空想的社会主义和非科学的社会主义。
1913年，列宁在《马克思主义的三个来源和三个组成部分》中，正式提出马克思主义包括马克思主义哲学、马克思主义政治经济学和科学社会主义。
科学社会主义在中国的发展阶段，国内学者有很多划分方法，有“五阶段”
划分法[11]，也有“三阶段”
的划分[12]，应该说这些划分都有其合理性和内在依据，这里我们暂且援引中国人民大学国际关系学院高放先生的划分方法，把我国科学社会主义的发展分为四个阶段：第一个阶段，从1899年到1919年，是科学社会主义在我国的初步介绍、片面传播阶段，对中国旧民族主义革命产生局部作用的阶段。
第二个阶段，从1919年到1949年，是科学社会主义的全面传播时期，由中国共产党结合中国实际，领导中国新民主主义革命取得全国胜利的阶段。
第三个阶段，从1949年到1978年，是科学社会主义广泛传播，由中国共产党结合中国实际，领导全国人民在社会主义革命和社会主义建设大道上曲折前进的阶段。
第四个阶段，从1978年至今，是科学社会主义重新研究和传播，由中国共产党结合中国实际，领导中国实行社会主义改革开放和现代化建设取得重大成就的阶段。
2.科学社会主义学科的现状
总体来看，当前的科学社会主义学科状况呈现下滑的趋势，学科地位也逐渐下降，学科发展的后劲不足等问题比较严重，但是我国的科学社会主义学者在近些年的教学科研活动中仍然取得了丰富的成果，培养了一大批优秀的科学社会主义人才。
随着中共中央下发了《中共中央关于进一步繁荣发展哲学社会科学的意见》（以下简称《意见》）和马克思主义理论研究和建设工程的实施，我国科学社会主义学科建设获得了前所未有的大好发展机遇。
具体来看，当前科学社会主义学科建设现状主要表现在以下四个方面。
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