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例如，在与世隔绝的加拉帕戈斯群岛上，他发现了一些显然是起源于在大陆的祖先但不知怎么地已渐渐变得不同的物种。
这一点粉碎了古老的物种不变论，但是，变异是怎么发生以及为什么会发生的问题仍未得到解答。
考察回来的两年后，他认托马斯·马尔萨斯写的一本书中得到了启示；马尔萨斯在那本书中提出了一种理论：如果不消除过剩的人口，人口要比食物增长得快。
1838年10月，我为了消遣而偶然读到了马尔萨斯的人口论，而我由于长期不断观察动植物的习惯，对这种到处都在进行看的生存斗争，思想上早就容易接受，现在读了这本书立刻使我想起，在这些情况下，有利的变异常常容易保存，而不利的变异就常常容易消灭。
它的结果就会形成新的物种。
这样我终于得到一个能够说明进化作用的学说了。
达尔文以其通常的谨慎和不辞劳苦的细心发展这一学说。
1839年，他开始拟草稿；3年后，它仍仅仅是一份用铅笔写成的35页的提纲。
到1844年，他已将它扩展成230页的论文。
那年，他给一位朋友写信说：
……我己阅读了大量的农艺和园艺方面的书，从未停止过搜集事实。
终于来了一点光明，我几乎确信（和我开始对的看法完全相反）物种并不是（这就象供认一件谋杀罪似的）永远不变的。
上帝不让我相信拉马克的一个"
进步的趋向"
、"
源于动物的缓慢的意欲的适应"
之类的废话。
但是，我得出的结论并非全然不同于他的结论，只是更换的方法完全不同于他的。
我想我已发现（这里是推测！
）物种微妙地适应各种结局的简单方式。
然而，达尔文仍不能使自己发表其研究结果。
他继续进一步按集证据，直到1858年收到另一位博物学家艾尔弗雷德·拉塞尔·华莱土（1823-1913年）的一封惊人的信时。
华莱士曾居住巴西和荷属东印度群岛多年，在那些地方吸收了极大量的动物学知识。
1858年2月，当他在摩鹿加群岛的特尔纳特岛上患疟疾卧床休息时，他想到了他也读过的马尔萨斯的著作，突然，最适者生存是实现进化的途径这一念头在他脑子里掠过。
华莱士的脾性和达尔文完全不同，他立即将自己的思想诉诸文字。
当天夜里，尽管仍受着发烧的折磨，他还是起草了自己的新学说。
以后两晚，他将它写成文章，然后寄给了达尔文；他与达尔文是经常通信的。
1858年6月，达尔文收到了这份手稿；他因读到的是一份他已写成的东西的概要，惊呆了。
"
我从未见过比这更惊人的巧合"
，他给查尔斯·赖尔去信说，"
即使华莱士已得到我在1842年写下的手稿，他也不可能写出比这更好的简短提要！
甚至他的话现在可放在我每章的上端。
"
达尔文对于公布自己的研究成果一事不再犹豫了。
1858年7月1日，他在伦敦向学会宣读他自己的论文和华莱土的论文，所谓达尔文的进化假说给提出来了。
达尔文在他于1859年出版的主要著作《物种起源：借助于自然选择即生存斗争中的适者生存》中更详细地阐述了自己的思想。
达尔文的主要论点——他的进化学说——是，处于现在各种不同形式中的动植物种类不是作为单独的、特殊的创造行为的结果而固定不变的，而是有共同的原始起源的、不同的、变化中的自然结果。
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