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此虫即蚜虫，五倍子是蚜虫寄生于盐肤木而形成的虫瘿。
其他如天南星和虎掌原是一种植物，旧书却误为两种药。
旋花能益气续筋，属旋花科，山姜属姜科；黄精是一种补药，无毒，钩吻却有剧毒，但有的本草误言“旋花即山姜”
、“黄精即钩吻”
。
兰花是兰科植物，可作观赏用，兰草是菊科植物，可治感冒，宋药物学家寇宗奭却言“兰花为兰草”
。
天花粉为栝楼根，栝楼则是栝楼的果实，宋名医苏颂竟认为天花粉和栝楼是两种植物。
硝石也称火硝（主要成分是硝酸钾），芒硝又名水硝（主要成分是含水硫酸钠），历代本草皆不清楚二者的成分差别，错加解释。
对上述这些错误，李时珍皆一一加以订正，防止了谬种流传。
第三，广录旧本草所不载，但实有功效的新药种。
李时珍在行医中发现三七对跌打损伤的疗效很高，便将它收入《本草纲目》，并详细记载了其名称由来、药用价值及疗效。
曼陀罗又名山茄子，有麻醉作用，东汉名医华佗曾创制“麻沸散”
，但后来此药失传，无人知其如何制取。
李时珍根据民间传说曼陀罗花酿酒可致人笑、舞的说法，通过实验证实了曼陀罗花的麻醉功能，因而将它记入《本草纲目》。
如今，曼陀罗的麻醉作用已通过大量临床实验得到证实。
巴豆长期以来被作为泻药使用，独元朝王海藏言其亦可止泻，但并未加以论证。
李时珍仔细研究后确认巴豆是热性药物，可以祛寒，用以治疗因胃寒而致腹泻类疾患。
依此药理，他为近百名此类患者解除了痛苦，从而在《本草纲目》中为后人留下了巴豆用量大可以致泻，用量小又有止泻功能的宝贵论断。
朱砂对咽喉肿痛有良好疗效，当时只有武当山人采之；半边莲，田边湿地多有生长，可治毒蛇咬伤，但这些药在旧本草中皆无记载，赖李时珍将其收入《本草纲目》。
在《本草纲目》中，李时珍自己发现、收集的药物有374种，亲手收集的验方有8160个，约占全部验方的3／4。
第四，用科学的态度驳斥炼丹家们的迷信妄言。
古代炼丹家们鼓吹服食黄金能成仙，服用以水银、铅、锡、雄黄、硫黄等炼成的丹芭能长生不老或成仙。
对此，李时珍陈言人的血肉之躯并不能承受“金石重坠之物久在肠胃”
，并举古今食丹药致死者的悲剧事例告诫人们不可相信方士们的谎言。
但同时，李时珍也客观辩证地指出水银、丹砂、黑铅、雄黄等百余种金属矿物类药材的药用价值，并言明其毒性，指出用时必须十分慎重。
《本草纲目》所创制的16部大分类及60类小分类的药物分类法，是当时世界上最先进的药物分类法。
《本草纲目》不仅是一部空前的本草学著作，而且在化学、矿物学等方面也有较大的贡献。
该书在万历三十四年（1606年）传入日本，后又陆续传入朝鲜及欧洲各国，对此后各国的药物学、植物学、化学、矿物学的发展都产生了一定影响。
如达尔文在《人类的起源》（TheDesan）一书中，曾经引用《本草纲目》中关于金鱼颜色形成的史料来说明动物的人工选择。
李时珍一生除了钻研本草，著有《本草纲目》外，在脉学、诊断学以及一些中医理论方面，都有较高的造诣。
今存其医著尚有《濒湖脉学》、《奇经八脉考》、《脉诀考证》，已佚的还有《医案》、《五脏图论》、《三焦客难》、《命门考》、《白花蛇传》等。
王肯堂（1549—1613年），江苏金坛人，生于官宦之家，青少年时期博览群书，尤留意于医学，故很早就精于医道，于内科、儿科、针灸及外科手术等方面达到很高的造诣。
他曾医活过因难产致死的孕妇，为落耳者成功地实施过再植手术，以高超的外科技术为一病人割除了眼窝边的毒瘤。
王肯堂还擅长情绪疗法，他认为喜、怒、忧、思、悲、恐、惊七情，会直接导致许多疾病的发生和转化，从病因入手，运用情绪疗法可治好一些针药不能奏其效的患者。
有一位数考方中的举人，因喜悦过度，导致坐立不安、饮食难进之疾，王肯堂以猛推患者落水的办法，使之受惊猛醒，疾患顿去。
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